经中佛判真、妄二本，告阿难言：‘诸修行人，不能得成无上菩提，乃至别成声闻缘觉，及成外道，诸天魔王，及魔眷属，皆由不知二种根本，错乱修习;犹如煮沙，欲成嘉馔，纵经尘劫，终不能得。一者，无始生死根本：则汝今者，用攀缘心即意识，为自性者;二者，无始菩提涅槃，元清净体：则汝今者，识精元明即根性，能生诸缘，缘所遗者。’只因众生，遗真认妄，执妄为真，多依妄本而修，现前虽成九次第定，终无实果。第一卷三番破识，破尽无余，阿难方肯舍妄求真，求示寂常心性，惟愿如来，发妙明心即根性真本，开我道眼求开圆解，以后十番显见，即指根性为真心。古德云：‘显见即所以显心者’是也。
先则十番，极显其真：一、显见是心;二、显见不动;三、显见不灭;四、显见不失，五、显见无还;六、显见不杂;七、显见无碍;八、显见不分;九、显见超情;十、显见离见。后则二见，略破其妄非同破识根本全妄。阿难既求示真心，如来不得不与指出，若向众生分上，指出纯真无妄之心，绝对无可指，故只得先带妄显真，后再与剖妄出真。交光法师，喻明此理甚妙：‘阿难认识为心，如愚人执石为玉，不肯放弃，佛为带妄显真，指见是心，如指璞说玉，璞虽是玉，尚有石皮未破，其玉不纯，故又为破同分、别业二种妄见，如剖璞出玉，光莹焕发矣。’佛为指真心显根性即如来密因，故说此经。
四、示性定劝实证：凡夫、外道、小乘、权宗，其所修行，各皆有定，而悉无究竟者。何也?以其徒慕真修，不谙真本，全用识心，错乱修习。如经云：‘纵灭一切见、闻、觉、知，内守幽闲，犹为法尘，分别影事。’斯则诸凡夫天，乐修禅而未决择者，所修八定、宁能出此境界?又云：‘分别都无，非色非空，拘舍离等，昧为冥谛。’则知一切外道，所修之定，亦同用缘影之心。又云：‘一切世间，诸修行人，现前虽成九次第定，不得漏尽，成阿罗汉，皆由执此生死妄想，误为真实。’是知，诸小乘人，所用之心，亦非真实心。又如来咄破识心之后，阿难云：‘若此发明，不是心者，我乃无心，同诸土木。兼此大众，无不疑惑!’大众应摄权教菩萨，以始教权乘，全取第六识，作我、法二空观，其所修之定，有入定、住定、出定，亦非究竟坚固之性定。
如上所述，终无实果，凡、外定销，或降德贬堕，散入诸趣;或从无想外道天，因谤三宝，直入地狱;小虽不堕，了无进境;权虽略进，亦不远到。推其病源，皆由以生灭心，为本修因，不能发明不生灭性也。经中阿难请定，如来首先三番破识者，即是决定，令舍生灭识心，撤去大定之障碍，后乃广显见性，不生灭、不动摇，决定令悟自性本定，依真常根性，成因地心，然后圆成，果地修证。四卷末云：‘若弃生灭，守于真常，常光现前，根、尘、识心，应念销落。’乃至‘云何不成无上知觉?’五卷偈云：‘如幻三摩提，弹指超无学。’此皆指示凡、外、权、小，令修真常性定，得证真实圆通也。
六卷文殊承命选择，偈答如来云：‘此方真教体，清净在音闻，欲取三摩提，实以闻中入。’又云：‘此是微尘佛，一路涅槃门。’乃至结云：‘但以此根耳根修，圆通超余者，真实心如是。以上诸文，皆是曲开巧修之门，指示性定，第八卷如来详列历证之位，皆欲导其深入，抵于实果而后已。佛为示性定、劝实证，故说此经。
五、销倒想除细惑：良以众生，元明失照，妄识纷乱，或迷心在身内;或认法居心外;或固执因缘，而系缚权宗;或谬执自然，而驰骋外计;皆为倒想，足障真修。斯经第九番显见超情，正遣因缘、自然，二种妄情计执。约如来藏不变义，以破因缘;约如来藏随缘义，以破自然;会四科一一本如来藏，妙真如性，双非因缘、自然;融七大文中，一一责为世间无知，惑为因缘、自然;皆是识心分别计度，但有言说，都无实义：此皆销倒想之文也。
但倒想先销，细惑未尽，虽信诸法唯心，未彻唯心之本源;固知五大圆融，未了圆融之深故，仍能障乎性定。是故阿难希更审除，早登妙觉，由是满慈蹑前以质二疑：一、疑万法生续之因，问云：‘若复世间，一切根、尘、阴、处、界等，皆如来藏，清净本然。云何忽生山、河、大地，诸有为相，次第迁流，终而复始。’二、疑五大圆融之故，问云：‘又如来说：“地、水、火、风，本性圆融，周遍法界，湛然常住。”世尊!若地性遍，云何容水?水性周遍，火则不生，复云何明。水、火二性。俱遍虚空，不相陵灭;世尊!地性障碍，空性虚通，云何二俱周遍法界?而我不知，是义攸往。’此二均属细惑。
如来逐答，以释二疑。先说不空藏，以示万法生续之因：因于性觉必明，妄为明觉，以为其咎，由是三细俄兴，六粗竞作，故有世界、众生、业果三种，始而忽生，终而相续;犹如捏目，乱华发生。后说空不空藏，以示五大圆融之故，喻明性相无碍。文云：‘譬如虚空，体非真相，而不拒彼诸相发挥，五大一一相妄性真，亦复如是。’相妄，本无生灭，不倾夺则诸碍何成?性真，先非水火，能合融则万用齐妙。些二即是审除。
至满慈索妄因而拟进修，佛答妄元无因，譬如演若达多，迷头认影，狂怖妄出，岂有因缘;忽然狂歇，头非外得，纵未歇狂，亦何遗失?乃至三缘断故，三因不生，则汝心中，演若达多，狂性自歇，歇即菩提;胜净明心，本周法界。阿难蹑佛语复执因缘，如来叠拂深情，本然非本然，和合非和合，合然俱离，离合俱非，此句方名，无戏论法。种种委细详示，方得疑惑销除，心悟实相：佛为销倒想除细惑，故说此经。
六、明二门利今后：惟有圆实教家，方能二门双具。一、平等门：一心万法，本原无差，平等一相，心为大总相法门体，世出世间，凡、圣;染、净;依、正;因、果，无不从心建立，以心为体，离心无有一法可得。即如经中所云：‘诸法所生，唯心所现，一切因果，世界微尘，因心成体。’心法虽有二名，其实一体一相，平等无差;如依金作器，器器皆金，器虽成多，金原是一，离金则无器可得;心生万法，法法唯心，亦复如是，惟有一真是实，诸妄本空，所有凡、圣;染、净;依、正;因、果，一切差别之相，了不可得。此即圆实家，‘知真本有，达妄本空’，非同拨无因果之邪见。二、方便门：于诸法中，分真、分妄;许破、许显，乃有迷、悟;修、证，种种差别，良以真虽本有，而迷之已久，不方便显之，则终不能见;妄虽本空，而执之已深，不方便破之，则终不能觉;纵了见分明，若不假方便，舍妄从真，则终不能入。此经乃圆实家，善巧方便，明知迷悟只一途，圣凡无二路，巧从方便门，拣择真妄，然后舍妄从真，及至深心，普融一味，知真本有，达妄本空，非同权宗，真、妄条然，迷、悟迥别也。
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